“微臣愚见，其一，李可灼是庸医，当按庸医杀人治罪。他有意轻用药，方从哲明知其谬而引荐，轻用药之罪固大，而轻荐庸医之罪亦不小。”’
“其二，泄药之害大于“红九”，崔文升之罪大于李可灼。崔文升为郑贵纪心腹，他投药之意即郑氏之意，崔文升其罪不下于当年张差（梃击案主角），而李可灼次之。当寸斩崔文升以谢九庙。”
“其三，从张差“梃击”东宫到李可灼“红九”，是出于同一阴谋，都是为了谋害先皇，“张差之棍不灵，则投以丽色之剑，崔文升之泄不速，则促以李可灼之丸咽。因此，李可灼之药，不合之崔文升不备。”
“其四，崔文异、李可灼等人是有组织的“医药奸党”，首辅方从哲大人是他们的后台。首辅对李可灼先是赏银奖励，后改宽大罚俸，继而让其养病调理。故首辅之罪应与崔、李二人相等。”
给事中杨涟慷慨激昂的念着其的奏折，身后站满了朝中大臣，彻史郭如楚、冯二元、刘宗周、焦源泻、博宗龙、马谨皋、李希孔、吏部主事吕维棋、工科右给事中惠世扬、吏科都给事中魏大中、光禄寺少卿高攀龙、礼部尚书孙慎行，以及南京太常寺少卿曹珍等四十余人，个个神色坚毅。
内阁首辅方从哲这时是脸色铁青，只差当场晕倒了，这些日子以来弹劾自己的折子方从哲已是见了许多，自己早已有了心里准备，前几日听闻东林党的密谋要聚众弹劾自己，没想到今日竟有40多人站出来了，看来东林党是想一次致自己于死地，不过自己已任内阁首辅七年有余，朝中门生遍布，岂是如此好扳倒的吗。这时向刑部尚书黄克缵示了示意。
黄克缵见了东林党众人弹劾方从哲早就想出来反驳，这番见了方从哲的眼神，立刻出列说道：“皇上，先帝平素就有弱疾，登基后又是因神宗皇帝仙逝哀痛不已，为国事劳累过度，以至医药无效而逝世。崔文升、李可灼等人进药无效，但亦是臣子爱君之心也，有何之罪，再说方大人赏银李可灼亦是皇上之意，方大人何罪之有？”
其实当初方从哲赏银给李可灼之前有询问过朱由校的意见，这些大臣都不在场，并不知情，这下可好，本来想弹劾方从哲，如今被方从哲一把就卸到朱由校这里了。
朱由校高高的坐在高高金鸾殿上，看着下面群臣是唇枪舌战，你来我往，煞是热闹。心中那是郁闷，自从大早上爬起来上朝到现在，朱由校是一句话也插不上，只能看着这些大臣小丑般的演出，这时殿下的一众大臣已是火yao味十足，个个不开口还好，一开口就是谋逆、造反、篡国。大臣们分成两大阵营，以东林党为主的要求处罚崔文升、李可灼连带方从哲，另外一部以方从哲为首的浙党，亓诗教为首的齐党，当然是为方从哲辩护。
朱由校一看形势不对，本来昨日以为今日之分歧主要是在崔文升和李可灼，现在看来，其两人已是配角，大家的目标都放到方从哲上来了。心想，这方从哲虽然与宫中郑贵妃和西李有联系，倒也不是谋逆拭君之辈，今日看来就是党争了。党争之事，朱由校倒是知道一二，现下朝中势力最大的当是内阁首辅方从哲所在的浙党，但是东林党也是势力庞大，双方已是斗争多年，今日借着这红丸案便互相斗起来。党争这东西，朱由校是非常反对的，党争说来倒是有点民主的气氛，可是这党争危害却是十分巨大，官员整日忙于党争，根本就无心情处理公务，特别是党争时容易造成对方支持的我就反对这种情况，所以朱由校向在管理朝会秩序的御史示了示意，决定打断大臣们的争论。
御史一见皇上示意便上前维持秩序，过了片刻大臣们安静了下来，都看着朱由校，等着朱由校最后拍板。朱由校一看怎么和开辩论会一样，大家辩论完毕等着评委评分一样。好在今日如何处理，昨日已经准备妥当，照着昨日想好的说便是了。那便是拖，自己现在虽然已是登基，但是帝位不甚稳固，这般情况下，随便撤换内阁首辅那是不行，所以这个问题只能拖。便说道：“崔文升、李可灼之案事关先帝清誉，马虎不得，便让刑部会审好了，等调查清楚，再来决定不迟。”
诸位大臣一看皇帝无意处理，一拖了事，知道今日再说亦是无用，便不再争论，想两党争执亦不是一天两天，来日方长。
这时朱由校又示意魏朝退朝。
于是魏朝上前喊道：“有事启奏，无事退朝。”
说毕朱由校也不管大臣们反应就起身离开，看了朝中大臣的这般表演，已是烦躁不安，心早就飞走了，现下如何还能等，这就是皇帝的好处。
朱由校一退朝便前往文华殿等孙承宗前来讲读，一进文华殿见里面已经准备妥当，只等孙承宗前来。
却说孙承宗刚刚在早朝上见识了一番唇枪舌战，心想自己今日还要给皇帝上课，皇帝一退朝，便有宫中太监来领着孙承宗前往文华殿。这孙承宗前几日便听闻众顾命大臣意以自己为帝师，自己毫不相信，可是昨日做梦般的来了圣旨说是晋升自己为詹事府少詹事，并要自己准备去文华殿讲读。天子老师，那是多么荣耀的事情，而且和皇帝亲近，地位显赫。孙承宗多年来一直在翰林院不死不活的挨着，今日倒是搭上了朝廷党争的顺风车，这些年来自己从不介入党争，今日倒是苦尽甘来。
想着想着已经到了文华殿，孙承宗一见朱由校便向朱由校行礼。
朱由校见孙承宗来了便说道：“朕今日请孙爱卿为朕讲读，不过朕有些要求，不知孙爱卿能否答应朕。”
孙承宗心想你是皇上，还不是你说了算，便回道：“皇上，微臣为皇上讲读，定当尽心尽力，好让皇上成为博闻广记的万古明君。”
朱由校又说道：“我知孙爱卿知识渊博，不过朕想问爱卿准备教朕些什么。”
孙承宗一愣，自己昨日接到圣旨后还特意去查询应该教皇帝些什么东西。于是说道：“皇上，臣等当先给皇上讲四书五经，以后再给皇上讲治国之策。”（明朝皇室成员读书特别奇怪，读书和写字不同的人教，读书时，老师从四书五经中挑选一些警句读一遍，然后学生跟着读五遍）